Rüstem Bey ve Sultan Hatun Türbesi, Seyyid Harun Cami’nin kuzeyinde olup Halife Sultan Türbesi’nin kuzey duvarına bitişiktir. Cami önünde yer alan üç kümbetten en küçüğü olan türbenin inşa tarzı ve malzemeleri diğerlerinden farklı olup yapının kare plan üzerine kesme taş kaplamalarla yükselen bir gövdesi bulunur. Seyyid Harun Veli Külliyesi’ne bağlı bu türbenin ne zaman yaptırıldığı bilinmemekle birlikte, içindeki en eski mezarın Turgutoğlu Emir Şah Bey'in kızı Sultan Hatun'a ait olması nedeniyle türbenin 1422’de onun ölümünden sonra yapıldığı tahmin edilmektedir.
Dört köşe bir temel üzerine kurulmuş küçük bir yapı olan türbe içten bir kubbe dıştan bir kümbet ile çevrilmiştir. Doğu tarafında küçük bir kapı açılmış olan türbenin batı ve kuzey cephesinde birer penceresi bulunmaktadır. Türbe içerisinde beş mezar bulunmakta olup, bunlar Sultan Hatun, Rüstem Bey, Rüstem Beyoğlu Ali Bey, Rüstem Bey kızı Dürrühand Hatun ve Yusuf Bey’e ait mezarlardır. Mermerden yapılmış olan mezar taşları XIII. ve XIV. yüzyıl taş işçiliğinin birer şaheserleri olarak dikkat çekmekte ve mezar taşlarında, Kur’an-ı Kerimden ayetler ile Sadi Şirazi’den Farsça beyitler bulunmaktadır. Bunlar arasında en çarpıcısı ah ölüm, ah ayrılıktır. Hayatın sonunu ve dünyanın geçiciliğini vurgulayan bu ifadelerin yanı sıra türbedeki son derece süslü ve muhteşem mezar taşları size hayatla ilgili çok şey fısıldayacaktır.